cytofast

DOI:10.18129 / B9.bioc.cytofast

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cytofast。

cytofast——快速CyTOF数据可视化和分析工具

Bioconductor版本:3.9

不确定型质量流和血细胞计数允许特殊高分辨率勘探的细胞免疫系统的组成。连同工具FlowSOM和Cytosplore可以识别新的细胞类型。通过引入cytofast我们希望提供可视化的工作流和量化细胞集群的一个有效的发现与疾病相关的细胞群或其他临床结果。

作者:·斯塔姆(aut (cre), g . Beyrend (aut)

维护人员:·斯塔姆< k.a。斯塔姆在hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cytofast”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cytofast”)

HTML	R脚本	斯皮策
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,FlowCytometry,软件,可视化
版本	1.0.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	flowCore,ggplot2,ggridges,RColorBrewer,reshape2、统计、grDevicesRdpack、方法、网格FlowSOM
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cytofast_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	cytofast_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cytofast_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cytofast
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cytofast
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cytofast/
包下载报告	下载数据