ctsGE

DOI:10.18129 / B9.bioc.ctsGE

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ctsGE。

时间序列基因表达数据的聚类

Bioconductor版本:3.9

监督聚类的方法可能很多预测变量,如基因等,在时间序列数据集提供了功能,帮助用户分配基因组预定义的模型配置文件。

作者:米甲Sharabi-Schwager (aut (cre),罗恩俄斐(aut)

维护人员:米甲Sharabi-Schwager < michalsharabi gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ctsGE”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ctsGE”)

HTML	R脚本	ctsGE包
PDF		参考手册

细节

biocViews	贝叶斯,聚类,DifferentialExpression,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,TimeCourse,转录
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.2)
进口	ccaPP,ggplot2,limma,reshape2,闪亮的统计数据,stringr,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,dplyr,DT,GEOquery,knitr,老鸨,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/michalsharabi/ctsGE
BugReports	https://github.com/michalsharabi/ctsGE/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ctsGE_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ctsGE_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	ctsGE_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ctsGE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ctsGE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ctsGE/
包下载报告	下载数据