cosmiq

DOI:10.18129 / B9.bioc.cosmiq

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅cosmiq。

cosmiq——结合单质量数量

Bioconductor版本:3.9

cosmiq预处理是一种工具的液体或气体,色谱质谱(LCMS / GCMS)数据集中在代谢组学或lipidomics应用程序。改善低丰富的信号检测,cosmiq生成主地图mZ / RT空间的所有获得运行前峰值检测算法。结果是一个更健壮的女士低强度信号的识别和量化相比,传统的方法挑选峰值分别在每个LCMS /模型文件执行。cosmiq包构建在xcmsSet对象结构,因此可以集成与包xcms作为替代预处理步骤。

作者:大卫•费舍尔在googlemail.com < dajofischer >基督教Panse < fgcz.ethz cp。ch >, Endre Laczko < Endre。在fgcz.uzh.ch laczko >

维修工:大卫费舍尔< dajofischer googlemail.com >,基督教Panse < cp在fgcz.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“cosmiq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“cosmiq”)

PDF	R脚本	cosmiq底漆
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.2),Rcpp
进口	pracma,xcms,MassSpecWavelet,faahKO
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/devel/bioc/html/cosmiq.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	cosmiq_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	cosmiq_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	cosmiq_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cosmiq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ cosmiq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cosmiq/
包下载报告	下载数据