cobindR

DOI:10.18129 / B9.bioc.cobindR

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见cobindR．

寻找转录因子结合位点的共现基序

Bioconductor版本:3.9

发现和分析基因组中转录因子结合位点的共发生基序

作者:Manuela Benary, Stefan Kroeger, Yuehien Lee, Robert Lehmann

维护者:Manuela Benary < Manuela。贝纳利在cms.hu-berlin.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("cobindR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“cobindR”)

PDF	R脚本	使用cobindR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，ChIPSeq，MultipleComparison，SequenceMatching，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	方法,seqinr，yaml，rtfbs，gplots，mclust，gmp，BiocGenerics(> = 0.13.8),IRanges，Biostrings，BSgenome，biomaRt
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了	rGADEM，seqLogo，genoPlotR平行,维恩图，RColorBrewer，vcd，MotifDb，降雪
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	cobindR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	cobindR_1.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	cobindR_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cobindR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/cobindR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cobindR/
软件包下载报告	下载数据