Chimeraviz

doi:10.18129/b9.bioc.chimeraviz

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Chimeraviz

基因融合的可视化工具

生物导体版本:3.9

Chimeraviz从融合基因发现器中管理数据,并提供有用的可视化工具。

作者:StianLågstad[Aut,Cre],Sen Zhao [CTB],Andreas M. Hoff [CTB],Bjarne Johannessen [CTB],Ole ChristianLingjærde[CTB],Rolf Skotheim [CTB] [CTB]

维护者:stianLågstad

引用(从r内,输入引用(“ Chimeraviz”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chimeraviz”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Chimeraviz”)

html R脚本 Chimeraviz
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GVIZ,,,,S4VECTORS,,,,Ensembldb,,,,AnnotationFilter,,,,Data.Table
进口 方法,网格,rsamtools,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,rcolorbrewer,图形,AnnotationDbi,,,,rcircos,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,rmarkDown,,,,图形,,,,rgraphviz,,,,DT,,,,plyr,,,,dplyr,,,,生物使用,,,,参数检查,,,,gtools
链接
建议 测试,,,,roxygen2,,,,DevTools,,,,尼特,,,,林特
系统要求 某些功能需要Bowtie,Samtools和Egrep
增强
URL https://github.com/stianlagstad/chimeraviz
BugReports https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Chimeraviz_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 Chimeraviz_1.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Chimeraviz_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/chimeraviz
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/
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