该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Chimeraviz。
生物导体版本:3.9
Chimeraviz从融合基因发现器中管理数据,并提供有用的可视化工具。
作者:StianLågstad[Aut,Cre],Sen Zhao [CTB],Andreas M. Hoff [CTB],Bjarne Johannessen [CTB],Ole ChristianLingjærde[CTB],Rolf Skotheim [CTB] [CTB]
维护者:stianLågstad
引用(从r内,输入引用(“ Chimeraviz”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chimeraviz”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Chimeraviz”)
html | R脚本 | Chimeraviz |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GVIZ,,,,S4VECTORS,,,,Ensembldb,,,,AnnotationFilter,,,,Data.Table |
进口 | 方法,网格,rsamtools,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,rcolorbrewer,图形,AnnotationDbi,,,,rcircos,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,rmarkDown,,,,图形,,,,rgraphviz,,,,DT,,,,plyr,,,,dplyr,,,,生物使用,,,,参数检查,,,,gtools |
链接 | |
建议 | 测试,,,,roxygen2,,,,DevTools,,,,尼特,,,,林特 |
系统要求 | 某些功能需要Bowtie,Samtools和Egrep |
增强 | |
URL | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz |
BugReports | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Chimeraviz_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | Chimeraviz_1.10.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Chimeraviz_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/chimeraviz |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/ |
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