brainImageR

DOI:10.18129 / B9.bioc.brainImageR

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见brainImageR．

在神经发育过程中可视化基因集富集的框架

Bioconductor版本:3.9

BrainImageR是一个为用户提供他们的基因组在人脑中对应位置信息的软件包。这既是一个连续变量，也是一个易于解释的图像。BrainImageR还具有额外的功能，可以在发育阶段大致识别基因表达数据集对应的时间。空间基因集富集和发育时间点预测都与Allen脑图集参考数据进行了比较。

作者:Sara Linker [aut, cre]

维护者:Sara B链接器< Sara。链接在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("brainImageR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“brainImageR”)

超文本标记语言	R脚本	brainImageR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GenePrediction，GeneSetEnrichment，软件，转录
版本	1.1.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(1年)
许可证	Cc by-sa 4.0
取决于	R (>= 3.5)
进口	BiocGenerics，ExperimentHub，ggplot2， grDevices，网格，gridExtra、方法、randomForest，RColorBrewer统计数据,testthat
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/saralinker/brainImageR
BugReports	https://github.com/saralinker/brainImageR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	brainImageR_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	brainImageR_1.1.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	brainImageR_1.1.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/brainImageR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/brainImageR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/brainImageR/
软件包下载报告	下载数据