Biomvrcns

doi:10.18129/b9.bioc.biomvrcns

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Biomvrcns

多元生物学数据的副本编号研究和细分

生物导体版本:3.9

在此软件包中,为分割基因组数据设计和实施了隐藏的半马尔可夫模型(HSMM)和一个均匀的分割模型,目的是使用RNA-Seq或平铺阵列(例如RNA-SEQ或瓷砖阵列)协助转录本检测,以及副本编号分析使用ACGH或测序。

作者:Yang Du

维护者:yang du

引用(从r内,输入引用(“ Biomvrcns”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biomvrcns”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biomvrcns”)

PDF R脚本 Biomvrcns包装简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,遗传学,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件,,,,可视化,,,,ACGH
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 iranges,,,,基因组机,,,,GVIZ
进口 方法,mvtnorm
链接
建议 , 平行,GenomicFeatures,,,,DynamiCtreCut,,,,rsamtools,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 biomvrcns_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 biomvrcns_1.24.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) biomvrcns_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biomvrcns
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/biomvrcns
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biomvrcns/
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