biocGraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.biocGraph

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅biocGraph。

在生物信息学和用例图示例

Bioconductor版本:3.9

这个包提供了例子和代码,利用不同的图包由Bioconductor有关。

作者:李长<李。在isb-sib长。ch >,罗伯特先生< rgentlem fhcrc.org >,赛斯猎鹰Florian Hahne < sethf fhcrc.org > < fhahne fhcrc.org >

维护人员:Florian Hahne <弗洛里安。在novartis.com hahne >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“biocGraph”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“biocGraph”)

PDF	R脚本	使用Rgraphviz绘制图表的例子
PDF	R脚本	HOWTO布局通路
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphAndNetwork,软件,可视化
版本	1.46.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(12年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Rgraphviz,图
进口	Rgraphviz,geneplotter,图,BiocGenerics、方法
链接
建议	fibroEset,geneplotter,hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我	BiocCaseStudies
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	biocGraph_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	biocGraph_1.46.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	biocGraph_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocGraph
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ biocGraph
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/biocGraph/
包下载报告	下载数据