这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅beadarray。
Bioconductor版本:3.9
包能够读取bead-level数据(生口角和文本文件)输出BeadScan以及从BeadStudio bead-summary数据。质量评估方法和低层次的分析。
作者:马克·邓宁迈克史密斯,乔纳森•凯恩斯安迪•林奇马特里奇
维护人员:马克邓宁< m.j。邓宁在sheffield.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“beadarray”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“beadarray”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“beadarray”)
R脚本 | beadarray.pdf | |
R脚本 | beadlevel.pdf | |
R脚本 | beadsummary.pdf | |
R脚本 | ImageProcessing.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,软件 |
版本 | 2.34.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.8 (r - 2.3)(13.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可 |
取决于 | R (> = 2.13.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),hexbin |
进口 | BeadDataPackR,limma,AnnotationDbistats4,reshape2,GenomicRanges,IRanges,illuminaio、方法、ggplot2 |
链接 | |
建议 | 光民,vsn,affy,hwriter,beadarrayExampleData,illuminaHumanv3.db,gridExtra,BiocStyle,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,ggbio,Nozzle.R1,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | beadarrayExampleData |
进口我 | arrayQualityMetrics,BeadArrayUseCases,blima,epigenomix |
建议我 | beadarraySNP,blimaTestingData,光民 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | beadarray_2.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | beadarray_2.34.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | beadarray_2.34.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beadarray |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ beadarray |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/ |
包下载报告 | 下载数据 |