贝塞克

doi:10.18129/b9.bioc.bayseq

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅贝塞克

经验贝叶斯对计数数据中差异表达模式的分析

生物导体版本:3.9

该软件包在高通量“计数”数据中识别差异表达,例如从下一代测序机中得出的差异表达,从经验贝叶斯方法计算差异表达(或更复杂的假设)的估计后验可能性。

作者:Thomas J. Hardcastle

维护者:thomas J. Hardcastle

引用(从r内,输入引用(“ bayseq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bayseq”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Bayseq”)

PDF R脚本 高级Bayseq分析
PDF R脚本 贝塞克
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,多重组合,,,,智者,,,,测序,,,,软件
版本 2.18.0
在生物导体中 Bioc 2.5(R-2.10)(10年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 2.3.0),方法,基因组机,,,,艾宾, 平行
进口 EDGER
链接
建议 生物使用,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我 clusterSeq,,,,埃达,,,,rcade,,,,片段,,,,TCC
进口我 埃达,,,,metaseqr,,,,riboseqr
建议我 compcoder
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 bayseq_2.18.0.tar.gz
Windows二进制 bayseq_2.18.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) bayseq_2.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bayseq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/bayseq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/bayseq/
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