arrayQualityMetrics

DOI:10.18129 / B9.bioc.arrayQualityMetrics

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见arrayQualityMetrics．

微阵列数据集的质量度量报告

Bioconductor版本:3.9

这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。支持单色和双色阵列平台。

作者:奥黛丽·考夫曼，沃尔夫冈·胡贝尔

维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在embl.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)

PDF	R脚本	高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理
PDF	R脚本	简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，质量控制，ReportWriting，软件，TwoChannel
版本	3.40.0
在Bioconductor	BioC 2.1 (R-2.6)(12年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于
进口	affy，affyPLM(> = 1.27.3),beadarray，Biobase，genefilter，图形，grDevices，网格，gridSVG(> = 1.4 3),Hmisc，hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、RColorBrewer，setRNG，统计，utils，vsn(> = 3.23.3),XML，svglite
链接
建议	ALLMLL，亚兰，BiocStyle，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/grimbough/arrayQualityMetrics/issues
全靠我	maEndToEnd
进口我	天哪
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	arrayQualityMetrics_3.40.0.tar.gz
Windows二进制	arrayQualityMetrics_3.40.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	arrayQualityMetrics_3.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/arrayQualityMetrics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/
软件包下载报告	下载数据