annaffy

DOI:10.18129 / B9.bioc.annaffy

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见annaffy

Affymetrix生物元数据的注释工具

Bioconductor版本:3.9

用于处理来自Bioconductor Affymetrix注释数据包的数据的函数。生成紧凑的HTML和文本报告,包括实验数据和许多在线数据库的URL链接。允许使用各种标准搜索生物元数据。

作者:Colin A. Smith < Colin at colinsmith.org>

维护者:Colin A. Smith < Colin at colinsmith.org>

引用(从R中,输入引用(“annaffy”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“annaffy”)

PDF R脚本 annaffy底漆
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释微阵列OneChannel通路ReportWriting软件
版本 1.56.0
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 14.5年)
许可证 LGPL
取决于 R(>= 2.5.0),方法,BiobaseGO.dbKEGG.db
进口 AnnotationDbi(> = 0.1.15),DBI
链接
建议 hgu95av2.db, tcltk
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 a4Basea4ReportingPGSEAwebbioc
进口我
建议我 AffyExpressArrayToolsBiocCaseStudies
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 annaffy_1.56.0.tar.gz
Windows二进制 annaffy_1.56.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) annaffy_1.56.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annaffy
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/annaffy
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/annaffy/
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  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网