此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见annaffy.
Bioconductor版本:3.9
用于处理来自Bioconductor Affymetrix注释数据包的数据的函数。生成紧凑的HTML和文本报告,包括实验数据和许多在线数据库的URL链接。允许使用各种标准搜索生物元数据。
作者:Colin A. Smith < Colin at colinsmith.org>
维护者:Colin A. Smith < Colin at colinsmith.org>
引用(从R中,输入引用(“annaffy”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“annaffy”)
R脚本 | annaffy底漆 | |
参考手册 |
biocViews | 注释,去,微阵列,OneChannel,通路,ReportWriting,软件 |
版本 | 1.56.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 14.5年) |
许可证 | LGPL |
取决于 | R(>= 2.5.0),方法,Biobase,GO.db,KEGG.db |
进口 | AnnotationDbi(> = 0.1.15),DBI |
链接 | |
建议 | hgu95av2.db,乘, tcltk |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | a4Base,a4Reporting,PGSEA,webbioc |
进口我 | |
建议我 | AffyExpress,ArrayTools,BiocCaseStudies |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | annaffy_1.56.0.tar.gz |
Windows二进制 | annaffy_1.56.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | annaffy_1.56.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annaffy |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/annaffy |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/annaffy/ |
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