affylmGUI

DOI:10.18129 / B9.bioc.affylmGUI

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见affylmGUI

使用Affymetrix微阵列的limma包的GUI

Bioconductor版本:3.9

使用affy和limma包分析Affymetrix微阵列基因表达数据的图形用户界面(GUI)。

作者:James Wettenhall [cre,aut], Ken Simpson [aut], Gordon Smyth [aut], Keith Satterley [ctb]

维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“affylmGUI”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“affylmGUI”)

超文本标记语言 about.html
PDF R脚本 affylmGUI装饰图案
超文本标记语言 CustMenu.html
PDF 从affylmGUI文件中提取affy和limma对象
超文本标记语言 index . html
超文本标记语言 windowsFocus.html
PDF 参考手册

细节

biocViews BatchEffect贝叶斯DataImportDifferentialExpressionGUIGeneExpression微阵列MultipleComparison归一化OneChannel预处理ProprietaryPlatforms质量控制回归软件TimeCourse转录mRNAMicroarray
版本 1.58.0
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 14.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口 grDevices,图形,统计,utils, tcltk,tkrplotlimmaaffyaffyioaffyPLMgcrmaBiocGenericsBiocManagerR2HTMLxtable
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://bioinf.wehi.edu.au/affylmGUI/
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 affylmGUI_1.58.0.tar.gz
Windows二进制 affylmGUI_1.58.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) affylmGUI_1.58.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affylmGUI
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affylmGUI
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affylmGUI/
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