这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见affylmGUI.
Bioconductor版本:3.9
使用affy和limma包分析Affymetrix微阵列基因表达数据的图形用户界面(GUI)。
作者:James Wettenhall [cre,aut], Ken Simpson [aut], Gordon Smyth [aut], Keith Satterley [ctb]
维护者:Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>
引文(从R内,输入引用(“affylmGUI”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“affylmGUI”)
超文本标记语言 | about.html | |
R脚本 | affylmGUI装饰图案 | |
超文本标记语言 | CustMenu.html | |
从affylmGUI文件中提取affy和limma对象 | ||
超文本标记语言 | index . html | |
超文本标记语言 | windowsFocus.html | |
参考手册 |
biocViews | BatchEffect,贝叶斯,DataImport,DifferentialExpression,GUI,GeneExpression,微阵列,MultipleComparison,归一化,OneChannel,预处理,ProprietaryPlatforms,质量控制,回归,软件,TimeCourse,转录,mRNAMicroarray |
版本 | 1.58.0 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 14.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | grDevices,图形,统计,utils, tcltk,tkrplot,limma,affy,affyio,affyPLM,gcrma,BiocGenerics,BiocManager,R2HTML,xtable |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://bioinf.wehi.edu.au/affylmGUI/ |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | affylmGUI_1.58.0.tar.gz |
Windows二进制 | affylmGUI_1.58.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | affylmGUI_1.58.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affylmGUI |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affylmGUI |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affylmGUI/ |
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