affycoretools

DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affycoretools

函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips

Bioconductor版本:3.9

各种包装器函数,写精简分析核心生物可能会看到更为普遍。

作者:詹姆斯·w·麦克唐纳

维修工:詹姆斯·w·麦克唐纳在u.washington.edu < jmacdon >

从内部引用(R,回车引用(“affycoretools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affycoretools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affycoretools”)

HTML R脚本 创建带注释的输出与\ Biocpkg {affycoretools}和ReportingTools
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpression,微阵列,OneChannel,ReportWriting,软件
版本 1.56.0
Bioconductor自 BioC 1.8 (r - 2.3)(13.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase、方法
进口 affy,limma,GOstats,gcrma样条函数,xtable,AnnotationDbi,ggplot2,gplots,oligoClasses,ReportingTools,hwriter,晶格,S4Vectors,刨边机,RSQLite,BiocGenerics,DBI
链接
建议 affydata,hgfocuscdf,BiocStyle,knitr,hgu95av2.db,rgl,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 AgiMicroRna
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 affycoretools_1.56.0.tar.gz
Windows二进制 affycoretools_1.56.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) affycoretools_1.56.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affycoretools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affycoretools/
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