affyILM

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyILM

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见affyILM．

背景减法的线性模型和朗缪尔等温线

Bioconductor版本:3.9

affyILM是一种预处理工具，用于估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。来自物理化学的输入被用于第一个背景减去强度，然后代表朗缪尔模型计算浓度。

作者:K.米利亚姆·克罗尔，法布里斯·伯杰，杰拉德·巴科玛，恩里科·卡隆

维护者:Myriam Kroll和Fabrice Berger < Fabrice。伯杰在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("affyILM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“affyILM”)

PDF	R脚本	affyILM1.3.0
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，预处理，软件
版本	1.36.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(9.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 2.10.0)，方法，gcrma
进口	affxparser(> = 1.16.0),affy、图形、Biobase
链接
建议	AffymetrixDataTestFiles，hgfocusprobe
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	affyILM_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	affyILM_1.36.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	affyILM_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyILM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affyILM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affyILM/
软件包下载报告	下载数据