affy

DOI:10.18129 / B9.bioc.affy

此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见affy．

Affymetrix寡核苷酸阵列方法

Bioconductor版本:3.9

该软件包包含探索性寡核苷酸阵列分析的功能。对tkWidgets的依赖只涉及少数方便函数。'affy'在没有它的情况下是完全可用的。

作者:Rafael A. Irizarry ， Laurent Gautier ， Benjamin Milo Bolstad ， Crispin Miller 的贡献来自Magnus Astrand ， Leslie M. Cope < Cope at mts.jhu.edu>， Robert Gentleman, Jeff Gentry, Conrad halalling < challingat agilixcorp.com>， Wolfgang Huber, James MacDonald ， Benjamin i.p. Rubinstein, Christopher Workman < Workman at cbs.dtu。dk>，张约翰

维护者:Rafael A. Irizarry

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“affy”)

PDF	R脚本	1.底漆
PDF	R脚本	2.内置处理方法
PDF	R脚本	3.自定义处理方法
PDF	R脚本	4.导入方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，预处理，软件
版本	1.62.0
在Bioconductor公司	BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 14.5年)
许可证	LGPL (>= 2.0)
取决于	R (>= 2.8.0)，BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase(> = 2.5.5)
进口	affyio(> = 1.13.3),BiocManager，图形，grDevices，方法，preprocessCore， stats, utils，zlibbioc
链接	preprocessCore
建议	tkWidgets(> = 1.19.0),affydata，widgetTools
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	affyContam，affydata，AffyExpress，affyPara，affypdnn，affyPLM，affyQCReport，AffyRNADegradation，AgiMicroRna，ALLMLL，altcdfenvs，AmpAffyExample，arrayMvout，ArrayTools，bgx，bronchialIL13，ccTutorial，ChimpHumanBrainData，慢性淋巴细胞白血病，Cormotif，curatedBladderData，curatedOvarianData，DrugVsDisease，dualKS，ecoliLeucine，ExiMiR，农场，frmaTools，gcrma，Hiiragi2013，LMGene，logitT，maPredictDSC，MAQCsubset，MAQCsubsetAFX，maskBAD，中长期规划，mvoutData，panp，plw，prebs，PREDAsampledata，pumadata，qpcrNorm，RefPlus，rHVDM，Risa，战，扫描。通用产品，simpleaffy，SpikeIn，SpikeInSubset，sscore，斯塔尔，webbioc，XhybCasneuf
进口我	affycoretools，affyILM，affylmGUI，affyQCReport，arrayQualityMetrics，ArrayTools，咖啡馆，ChIPXpress，coexnet，Cormotif，crossmeta，DeSousa2013，Doscheda，天哪，农场，ffpe，frma，gcrma，GEOsubmission，Harshlight，HTqPCR，iCheck，光民，LVSmiRNA，makecdfenv，mimager，MSnbase，PECA，钳子，plw，彪马，pvac，rat2302frmavecs，rCGH，Rnits，simpleaffy，STATegRa，tilingArray，TurboNorm，vsn，waveTiling
建议我	AnnotationForge，ArrayExpress，数组，beadarray，beadarraySNP，BiocCaseStudies，BiocGenerics，Biostrings，BufferedMatrixMethods，categoryCompare，ecolitk，雌激素，ExpressionView，factDesign，ffpeExampleData，gCMAPWeb，GeneRegionScan，limma，made4，paxtoolsr，钢琴，PREDA，qcmetrics，runibic，siggenes，TCGAbiolinks
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	affy_1.62.0.tar.gz
Windows二进制	affy_1.62.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	affy_1.62.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affy
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affy
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affy/
软件包下载报告	下载数据