adductomicsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.adductomicsR

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见adductomicsR．

内收质谱数据集的处理

Bioconductor版本:3.9

处理MS2数据，从已校正质量漂移和保留时间漂移的光谱中识别潜在的内收肽，并量化MS1级质谱峰值。

作者:Josie Hayes

维护者:Josie Hayes

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("adductomicsR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“adductomicsR”)

超文本标记语言	R脚本	Adductomics工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，GUI，MassSpectrometry，代谢组学，软件，ThirdPartyClient
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.6)，adductData，ExperimentHub，AnnotationHub
进口	并行(>= 3.3.2)，data.table(> = 1.10.4),OrgMassSpecR(> = 0.4.6),foreach(> = 3),mzR(> = 2.14.0),ade4(> = 1.7.6),房车(> = 0.3.2),pastecs(> = 1.3.18),reshape2(> = 1.4.2),pracma(> = 2.0.4),DT(> = 0.2),fpc(> = 2.1.10),doSNOW(> = 1.0.14),fastcluster(> = 1.1.22),RcppEigen(> = 0.3.3.3.0),引导(> = 2017.2),平滑(> = 1.1),dplyr(> = 0.7.5),动物园(> = 1.8),数据(> = 3.5.0),跑龙套(> = 3.5.0),图形(> = 3.5.0),grDevices(> = 3.5.0)、方法(> = 3.5.0),数据集(> = 3.5.0)
链接
建议	knitr(> = 1.15.1),rmarkdown(> = 1.5),Rdisop(> = 1.34.0),testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/JosieLHayes/adductomicsR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	adductomicsR_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	adductomicsR_1.0.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	adductomicsR_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adductomicsR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/adductomicsR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/adductomicsR/
软件包下载报告	下载数据