adSplit

DOI:10.18129 / B9.bioc.adSplit

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅adSplit。

注解驱动的集群

Bioconductor版本:3.9

这个方案实现了微阵列基因表达谱聚类根据功能注释。对于每个术语基因注释,分裂成两个子类是计算和一组支持基因的重要性决定。

作者:克劳迪奥·Lottaz Joern Toedling

维修工:克劳迪奥Lottaz <克劳迪奥。在klinik.uni-regensburg.de Lottaz >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“adSplit”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“adSplit”)

PDF	R脚本	注解驱动的集群
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,微阵列,软件
版本	1.54.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(13.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> =魅惑)、方法(> = 2.1.0的)
进口	AnnotationDbi,Biobase(> = 1.5.12),集群(> = 1.9.1),GO.db(> = 1.8.1)、图形、grDevicesKEGG.db(> = 1.8.1)、方法乘(> = 1.6.0),数据(> = 2.1.0的)
链接
建议	golubEsets(> = 1.0),vsn(> = 1.5.0),hu6800.db(> = 1.8.1)
SystemRequirements
增强了
URL	http://compdiag.molgen.mpg.de/software/index.shtml
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	adSplit_1.54.0.tar.gz
Windows二进制	adSplit_1.54.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	adSplit_1.54.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adSplit
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ adSplit
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/adSplit/
包下载报告	下载数据