acde

DOI:10.18129 / B9.bioc.acde

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅acde。

人工检测组件的差异表达基因

Bioconductor版本:3.9

这个包提供了一种多变量推理分析方法检测差异表达基因在基因表达数据。它使用人工组件,接近数据的主成分,但准确的解读差异基因表达,识别差异表达基因在控制错误发现率(罗斯福)。描述的方法在这个包的装饰图案或文章的多元方法推理识别差异表达基因在基因表达实验的j·p·阿科斯塔,l . Lopez-Kleine和s·雷斯特雷波(2015年,即将出版)。

作者:莉莉安娜Lopez-Kleine Juan Pablo Acosta

维护人员:胡安-帕布鲁Acosta < jpacostar在unal.edu.co >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“acde”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“acde”)

PDF	R脚本	与人工组件识别差异表达基因
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,微阵列,PrincipalComponent,软件,TimeCourse,mRNAMicroarray
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.3),引导(> = 1.3)
进口	统计数据、图形
链接
建议	BiocGenerics,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	coexnet
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	acde_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	acde_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	acde_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/acde
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ acde
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/acde/
包下载报告	下载数据