独立

doi：10.18129/b9.bioc.uniquorn

该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅独立。

基于其加权突变/变异指纹识别癌细胞系

生物导体版本：3.9

该包装使用户能够识别癌细胞系。癌细胞系错误识别和交叉污染对癌症研究人员的挑战为重大挑战。该识别是至关重要的，在该软件包的框架中，基于体细胞和种系突变/变化的位置/位点。输入格式为vcf/vcf.gz，文件必须包含一个癌细胞系样本（即VCF文件中的单个成员/基因型/GT列）。实施方法针对下一代外显子组和整个基因组DNA测序技术进行了优化。RNA-seq数据也很可能工作，但尚未经过严格测试。面板seq将需要手动调整阈值

作者：Raik Otto

维护者：'raik otto'

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ kityorn”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“独立”）

html	R脚本	独立小插图
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	Exomeseq，，，，免疫学，，，，软件，，，，统计信息，，，，全媒体
版本	2.4.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（3。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.5）
进口	Stringr，，，，r.utils，，，，writexls，统计多帕尔，，，，foreach，，，，基因组机，，，，iranges，，，，变体
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物基因，，，，运行
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Uniquorn_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	Uniquorn_2.4.0.zip
Mac OS X 10.11（El Capitan）	Uniquorn_2.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uniquorn
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/独立
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/uniquorn/
软件包下载报告	下载统计