这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Ularcirc。
Bioconductor版本:3.9
Ularcirc读入恒星对齐接头连接文件和剪接分析提供了可视化和分析工具。用户可以评估backsplice连接和转发规范连接。
作者:大卫·汉弗莱斯(aut (cre)
维护人员:大卫·汉弗莱斯< d。汉弗莱斯在victorchang.edu.au >
从内部引用(R,回车引用(“Ularcirc”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Ularcirc”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Ularcirc”)
HTML | R脚本 | Ularcirc |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | AlternativeSplicing,注释,报道,DataRepresentation,DifferentialSplicing,遗传学,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.2.21 |
Bioconductor自 | BioC 3.8 (r - 3.5)(1年) |
许可证 | 文件许可 |
取决于 | R (> = 3.4.0) |
进口 | AnnotationHub,AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,BSgenome,data.table(> = 1.9.4),DT,GenomicFeatures,GenomeInfoDb,GenomeInfoDbData,GenomicAlignments,GenomicRanges,ggplot2,ggrepel,gsubfn,mirbase.db,S4Vectors,闪亮的,shinyFiles,寿司,yaml |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,BiocStyle,httpuv,knitr,org.Hs.eg.db,rmarkdown,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | Ularcirc_1.2.21.tar.gz |
Windows二进制 | Ularcirc_1.2.21.zip |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | Ularcirc_1.2.21.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Ularcirc |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Ularcirc |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Ularcirc/ |
包下载报告 | 下载数据 |