TransView

DOI:10.18129 / B9.bioc.TransView

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TransView。

读密度地图建设和加入。ChIPSeq和RNASeq数据集的可视化

Bioconductor版本:3.9

这个包提供了有效的工具来生成,访问和显示读取基于密度的测序数据集从RNA-Seq和ChIP-Seq等。

作者:尤利乌斯•穆勒

维修工:朱利叶斯·穆勒在alumni.ethz.ch > < ju-mu

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TransView”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“TransView”)

PDF	R脚本	介绍TransView
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,聚类,DNAMethylation,DataImport,GeneExpression,ImmunoOncology,MethylSeq,微阵列,MultipleComparison,RNASeq,测序,软件,转录,可视化
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	方法,GenomicRanges
进口	BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,zlibbioc,gplots
链接	Rhtslib(> = 1.15.3)
建议	RUnit,pasillaBamSubset,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/TransView.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	TransView_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	TransView_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	TransView_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TransView
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TransView
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TransView/
包下载报告	下载数据