次级表演

doi:10.18129/b9.bioc.timeseriesexperiment

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅次级表演

短时间数据的分析

生物导体版本:3.9

可视化和分析工具箱的短时过程数据,包括降低维度,聚类,两样本差异表达测试和基因排名技术。该软件包还提供了检索丰富途径的方法。

作者:Lan Huong Nguyen

维护者:lan huong nguyen

引用(从r内,输入引用(“ LimeSeriesexperiment”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ limesereriesexperiment”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ Limeseriesexperiment”)

html R脚本 基因表达时间课程数据分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 聚类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,微生物组,,,,正常化,,,,途径,,,,委托人,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,时间科,,,,转录,,,,可视化
版本 1.2.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1年)
执照 LGPL(> = 3)
要看 r(> = 3.5.0),S4VECTORS(> = 0.19.23),总结性特征(> = 1.11.6)
进口 DynamiCtreCut,,,,dplyr,,,,EDGER,,,,deseq2,,,,GGPLOT2(> = 3.0.0),图形,HMISC,,,,林玛, 方法,马格里特,,,,代理人,统计蒂布尔,,,,花花公子,,,,素食主义者,,,,维里迪斯,UTILS
链接
建议 生物酶,,,,Biocfilecache(> = 1.5.8),循环,,,,复杂的图像,,,,go.db,grdevices,网格,尼特,,,,org.mm.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,大量的,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,insctr
系统要求
增强
URL https://github.com/nlhuong/timeseriesexperiment
BugReports https://github.com/nlhuong/timeseriesexperiment/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 limeseriesexperiment_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 limeseriesexperiment_1.2.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) limeseriesexperiment_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timeseriesexperiment
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/limeseriesexperiment
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/timeseriesexperiment/
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