该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅次级表演。
生物导体版本:3.9
可视化和分析工具箱的短时过程数据,包括降低维度,聚类,两样本差异表达测试和基因排名技术。该软件包还提供了检索丰富途径的方法。
作者:Lan Huong Nguyen
维护者:lan huong nguyen
引用(从r内,输入引用(“ LimeSeriesexperiment”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ limesereriesexperiment”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ Limeseriesexperiment”)
html | R脚本 | 基因表达时间课程数据分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 聚类,,,,差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,微生物组,,,,正常化,,,,途径,,,,委托人,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,时间科,,,,转录,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(1年) |
执照 | LGPL(> = 3) |
要看 | r(> = 3.5.0),S4VECTORS(> = 0.19.23),总结性特征(> = 1.11.6) |
进口 | DynamiCtreCut,,,,dplyr,,,,EDGER,,,,deseq2,,,,GGPLOT2(> = 3.0.0),图形,HMISC,,,,林玛, 方法,马格里特,,,,代理人,统计蒂布尔,,,,花花公子,,,,素食主义者,,,,维里迪斯,UTILS |
链接 | |
建议 | 生物酶,,,,Biocfilecache(> = 1.5.8),循环,,,,复杂的图像,,,,go.db,grdevices,网格,尼特,,,,org.mm.eg.db,,,,org.hs.eg.db,,,,大量的,,,,rcolorbrewer,,,,rmarkDown,,,,insctr |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/nlhuong/timeseriesexperiment |
BugReports | https://github.com/nlhuong/timeseriesexperiment/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | limeseriesexperiment_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | limeseriesexperiment_1.2.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | limeseriesexperiment_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timeseriesexperiment |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/limeseriesexperiment |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/timeseriesexperiment/ |
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