锡
DOI:10.18129 / B9.bioc.TIN
此包适用于Bioconductor的3.9版本;有关稳定的最新发布版本，请参见锡．
转录组不稳定性分析
Bioconductor版本:3.9
TIN包实现了一套基于外显子表达谱的转录组不稳定性分析工具。在剪接因子的背景下研究外显子的使用偏差，以分析转录组的不稳定性与剪接因子表达的相关程度。在转录组不稳定性相关分析中，将数据与备选剪接评分的随机排列和随机基因集的表达进行比较。
作者:Bjarne Johannessen, Anita Sveen和Rolf I. Skotheim
维护者:Bjarne Johannessen
引用(从R中，输入引用(“锡”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“锡”)
| R脚本 | TIN封装介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing，DifferentialSplicing，ExonArray，GeneExpression，遗传学，微阵列，软件 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.1 (R-3.2)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 2.12.0)，data.table，嫁祸于，aroma.affymetrix |
| 进口 | WGCNA，南瓜，stringr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，aroma.light，affxparser，RUnit，BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | TIN_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | TIN_1.16.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | TIN_1.16.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/TIN |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TIN |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TIN/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
