这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅TFutils。
Bioconductor版本:3.9
包使用TF数据。
作者:文森特•凯里(aut)什维塔Gopaulakrishnan (cre, aut)
维护人员:什维塔Gopaulakrishnan < reshg channing.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“TFutils”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TFutils”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“TFutils”)
HTML | R脚本 | TFutils——代表TFBS和TF目标集 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 软件,转录组 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.5.0) |
进口 | 方法,dplyr,magrittr,miniUI,闪亮的 |
链接 | |
建议 | knitr,data.table,GSEABase,testthat,AnnotationDbi,AnnotationFilter,Biobase,GenomicFeatures,GenomicRanges,Gviz,IRanges,Rsamtools,S4Vectors,org.Hs.eg.db,EnsDb.Hsapiens.v75,BiocParallel,BiocStyle,GO.db,GenomicFiles,GenomeInfoDb,SummarizedExperiment,UpSetR,ggplot2,png,gwascat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | TFutils_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | TFutils_1.4.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | TFutils_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFutils |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TFutils |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TFutils/ |
包下载报告 | 下载数据 |