TCC
doi：10.18129/b9.bioc.tcc
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅TCC。
TCC：标签计数数据的差分表达分析具有强大的归一化策略
生物导体版本：3.9
该软件包提供了一系列功能，用于使用可靠的归一化策略（称为度）从RNA-Seq计数数据中执行差异表达分析。学位的基本思想是，在数据归一化之前，应删除比较样品中的潜在差异表达的基因或转录本（DEG），以获得排名良好的基因列表，在该列表中，真正的DEG是顶级排名最高的，而非系列的排名最低。这可以通过执行多步规范化策略（称为DEG消除策略）来完成。TCC的一个主要特征是通过在依赖依据中使用功能组合来提供多种计数数据（具有或不重复的两组，多组/多因素等）的可靠归一化方法软件包。
作者：Jianqiang Sun，Tomoaki Nishiyama，Kentaro Shimizu和Koji Kadota
维护者：江仙
引用（从r内，输入引用（“ TCC”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tcc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ TCC”）
| R脚本 | TCC | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.13（R-3.0）（6年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.0），方法，deseq，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，贝塞克，，，，鹏 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | 雪 |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | compcoder |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tcc_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tcc_1.24.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | tcc_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tcc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/tcc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tcc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
