拖缆

DOI:10.18129 / B9.bioc.Streamer

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅拖缆

使流处理大型文件

Bioconductor版本:3.9

大型数据文件可以在R难以处理,数据通常驻留在内存中。这个包鼓励一个编程风格,数据从磁盘“流”到R通过“生产者”,通过一系列的“消费者”,通常减少原始数据在可控的范围内。包提供了有用的生产国和消费国流组件数据输入等操作,采样、索引、和转换;看到包吗?拖缆for details.

作者:作者Nishant Gopalakrishnan马丁•摩根

维修工:马丁·摩根<马丁。摩根在roswellpark.org >

从内部引用(R,回车引用(“流光”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“流光”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“流光”)

PDF R脚本 横幅:一个简单的例子
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport,基础设施,软件
版本 1.30.0
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(8年)
许可证 艺术- 2.0
取决于
进口 方法,,RBGL平行,BiocGenerics
链接
建议 RUnit,Rsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignments,Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 plethy
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Streamer_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 Streamer_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) Streamer_1.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Streamer
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/拖缆
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Streamer/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网