SigFuge

DOI:10.18129 / B9.bioc.SigFuge

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见SigFuge

SigFuge

Bioconductor版本:3.9

在RNA-seq数据中测试聚类显著性的算法。

作者:Patrick Kimes, Christopher Cabanski

维护者:Patrick Kimes < Patrick。Kimes在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“SigFuge”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SigFuge")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“SigFuge”)

PDF R脚本 SigFuge教程
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类ImmunoOncologyRNASeq软件可视化
版本 1.22.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.1.1),GenomicRanges
进口 ggplot2matlab重塑sigclust
链接
建议 org.Hs.eg.dbprebsdataRsamtools(> = 1.17.0),TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SigFuge_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 SigFuge_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) SigFuge_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SigFuge
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SigFuge
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SigFuge/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网