这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见SigFuge.
Bioconductor版本:3.9
在RNA-seq数据中测试聚类显著性的算法。
作者:Patrick Kimes, Christopher Cabanski
维护者:Patrick Kimes < Patrick。Kimes在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“SigFuge”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SigFuge")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“SigFuge”)
R脚本 | SigFuge教程 | |
参考手册 |
biocViews | 聚类,ImmunoOncology,RNASeq,软件,可视化 |
版本 | 1.22.0 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(6年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.1.1),GenomicRanges |
进口 | ggplot2,matlab,重塑,sigclust |
链接 | |
建议 | org.Hs.eg.db,prebsdata,Rsamtools(> = 1.17.0),TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | SigFuge_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | SigFuge_1.22.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | SigFuge_1.22.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SigFuge |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SigFuge |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/SigFuge/ |
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