seqsqc
doi：10.18129/b9.bioc.seqsqc
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅seqsqc。
使用下一代测序数据的用于样品质量检查的生物导体套件
生物导体版本：3.9
SEQSQC旨在识别NGS数据中的有问题的样本，包括性别不匹配，污染，隐性相关性和人群异常的样本。
作者：刘Qian [AUT，CRE]
维护者：Qian liu
引用（从r内，输入引用（“ seqsqc”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ seqsqc”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ seqsqc”）
| html | R脚本 | 使用SEQSQC样品质量检查下一代测序数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 实验数据，，，，基因组，，，，homo_sapiens_data，，，，project1000基因组，，，，测序数据，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.4），实验室（> = 1.3.7），Snprelate（> = 1.10.2） |
| 进口 | E1071，，，，基因组机，，，，GDSFMT，，，，GGPLOT2，，，，ggally，，，，iranges， 方法，rbokeh，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，，，，rmarkDown，，，，S4VECTORS，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/liubuntu/seqsqc |
| BugReports | https://github.com/liubuntu/seqsqc/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | seqsqc_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqsqc_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | seqsqc_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqsqc |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqsqc |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqsqc/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
