该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅StringDB。
生物导体版本:3.9
StringDB软件包为String蛋白 - 蛋白质交互数据库(http://www.string-db.org)提供了R接口。
作者:Andrea Franceschini
维护者:Damian Szklarczyk
引用(从r内,输入引用(“ StringDB”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ stringdb”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ StringDB”)
R脚本 | StringDB Vignette | |
参考手册 |
生物浏览 | 网络,,,,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.13(R-3.0)(6年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 2.14.0) |
进口 | PNG,,,,SQLDF,,,,plyr,,,,Igraph,,,,rcurl, 方法,rcolorbrewer,,,,GPLOTS,,,,哈希,,,,plotrix |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | ppinfer,,,,SCSR |
进口我 | coexnet,,,,Glmsparsenet,,,,我是男人,,,,杂种,,,,丽塔,,,,xina |
建议我 | Epinem,,,,GenEnetworkbuilder,,,,NetSmooth,,,,PCAN |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | StringDB_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | StringDB_1.24.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | StringDB_1.24.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stringdb |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/stringdb |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/stringdb/ |
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