碎片

doi:10.18129/b9.bioc.splinter

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅碎片

成绩单的剪接解释器

生物导体版本:3.9

Splinter提供了分析替代剪接位点的工具,基于序列信息来解释结果,选择和设计引物以进行站点验证,并提供事件的视觉表示以指导下游实验。

作者:Diana Low

维护者:diana low

引用(从r内,输入引用(“分裂”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ splinter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Splinter”)

PDF R脚本 碎片
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,可视化
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(3年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 3.4.0),grdevices,统计
进口 图形,GGPLOT2,,,,seqlogo,,,,生物弦,,,,Biomart,,,,基因组签名,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,GVIZ,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,utils,plyr,,,,Stringr, 方法,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,Googlevis
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Splinter_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 Splinter_1.10.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Splinter_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splinter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/碎片
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/splinter/
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