该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅碎片。
生物导体版本:3.9
Splinter提供了分析替代剪接位点的工具,基于序列信息来解释结果,选择和设计引物以进行站点验证,并提供事件的视觉表示以指导下游实验。
作者:Diana Low
维护者:diana low
引用(从r内,输入引用(“分裂”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ splinter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Splinter”)
R脚本 | 碎片 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,rnaseq,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(3年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 3.4.0),grdevices,统计 |
进口 | 图形,GGPLOT2,,,,seqlogo,,,,生物弦,,,,Biomart,,,,基因组签名,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,GVIZ,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,utils,plyr,,,,Stringr, 方法,bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,Googlevis |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Splinter_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | Splinter_1.10.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Splinter_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splinter |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/碎片 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/splinter/ |
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