此套餐适用于Biocumonds 3.9版;对于稳定的最新版本版本,请参阅斯维亚。
生物导体版本:3.9
该包装实现了使用该信息的信令通路影响分析(SPIA),其形成差分表达基因的列表及其日志折叠与信号通路拓扑一起改变,以识别与研究下的条件相关的途径。
作者:Adi Laurentiu Tarca
维护者:Adi Laurentiu Tarca
引文(从R内,输入引文(“SPIA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“3.6”)并输入:
if(!percenamespace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“spia”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“SPIA”)
PDF. | r script. | 斯维亚 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | graphandnetwork.那微阵列那软件 |
版本 | 2.36.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.4(R-2.9)(10.5岁) |
执照 | 文件许可证 |
依靠 | r(> = 2.14.0),图形,keggraph. |
进口 | 图形 |
链接到 | |
建议 | 图形那rghrachviz那hgu133plus2.db. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1 |
取决于我 | |
进口我 | enrichmentbrowser. |
建议我 | 石墨那keggraph. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
源包 | spia_2.36.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | spia_2.36.0.zip. |
Mac OS x 10.11(El Capitan) | spia_2.36.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/spia. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包装/斯普利 |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/spia/ |
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