SEPIRA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEPIRA

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SEPIRA。

系统表观基因组学推理的监管活动

Bioconductor版本:3.9

SEPIRA(系统监管活动的表观基因组学推理)是一种算法,推断sample-specific转录因子的活动从全基因组表达或DNA甲基化的样本。

作者:个陈(aut (cre),安德鲁Teschendorff (aut)

维护人员:个陈< cytwarmmay hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SEPIRA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SEPIRA”)

HTML	R脚本	介绍“SEPIRA”
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneRegulation,GeneTarget,网络,NetworkInference,软件,转录
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	limma(> = 3.32.5),corpcor(> = 1.6.9),并行(> = 3.3.1),统计数据
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,igraph
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SEPIRA_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	SEPIRA_1.4.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SEPIRA_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEPIRA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SEPIRA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SEPIRA/
包下载报告	下载数据