国家环保总局

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEPA

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅国家环保总局。

国家环保总局

Bioconductor版本:3.9

鉴于单细胞RNA-seq数据和真实实验时间的细胞或细胞伪时间排序,环保总局为用户提供了方便的功能分配基因等不同的基因表达模式不变,单调递增和增加然后减少。环保总局然后执行富集分析去分析基因的功能角色相同或相似的模式。

作者:至诚,Hongkai霁

维护人员:至诚霁< zji4 jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(SEPA)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (SEPA)

PDF	R脚本	国家环保总局:单细胞基因表达模式分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	去,GUI,GeneExpression,软件,可视化
版本	1.13.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0)
进口	ggplot2,闪亮的,topGO,分段,reshape2,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SEPA_1.13.0.tar.gz
Windows二进制	SEPA_1.13.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SEPA_1.13.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEPA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/环保总局
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SEPA/
包下载报告	下载数据