RQC

doi:10.18129/b9.bioc.rqc

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅RQC

高通量测序数据的质量控制工具

生物导体版本:3.9

RQC是一种优化的工具,旨在用于质量控制和评估高通量测序数据。它执行整个文件的并行处理,并产生包含一组高分辨率图形的报告。

作者:Welliton Souza,Benilton Carvalho

维护者:welliton souza

引用(从r内,输入引用(“ RQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rqc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ RQC”)

html R脚本 使用RQC
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 生物比较,,,,Shortread,,,,GGPLOT2
进口 生物基因(> = 0.25.1),生物弦,,,,iranges, 方法,S4VECTORS,,,,尼特(> = 1.7),生物使用,,,,plyr,,,,降价, 网格,RESHAPE2,,,,RCPP(> = 0.11.6),Biovizbase,,,,闪亮的,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,Genomicfiles
链接 RCPP
建议 测试
系统要求
增强
URL https://github.com/labbcb/rqc
BugReports https://github.com/labbcb/rqc/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 RQC_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 RQC_1.17.3.3.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) RQC_1.18.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rqc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rqc/
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