该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅RQC。
生物导体版本:3.9
RQC是一种优化的工具,旨在用于质量控制和评估高通量测序数据。它执行整个文件的并行处理,并产生包含一组高分辨率图形的报告。
作者:Welliton Souza,Benilton Carvalho
维护者:welliton souza
引用(从r内,输入引用(“ RQC”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rqc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RQC”)
html | R脚本 | 使用RQC |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 生物比较,,,,Shortread,,,,GGPLOT2 |
进口 | 生物基因(> = 0.25.1),生物弦,,,,iranges, 方法,S4VECTORS,,,,尼特(> = 1.7),生物使用,,,,plyr,,,,降价, 网格,RESHAPE2,,,,RCPP(> = 0.11.6),Biovizbase,,,,闪亮的,,,,rsamtools,,,,基因组签名,,,,Genomicfiles |
链接 | RCPP |
建议 | 测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/labbcb/rqc |
BugReports | https://github.com/labbcb/rqc/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | RQC_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | RQC_1.17.3.3.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | RQC_1.18.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rqc |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rqc/ |
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