这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RpsiXML。
Bioconductor版本:3.9
查询,数据结构和接口交互的可视化数据集。这个包inplements PSI-MI 2.5标准和支持到现在8数据库。进一步的数据库支持PSI-MI 2.5标准将不断增加。
作者:大卫•张Jitao Stefan Wiemann马克•卡尔森托尼蒋介石的贡献
维修工:Jitao大卫张< jitao_david。张在roche.com >
从内部引用(R,回车引用(“RpsiXML”)
):
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RpsiXML”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RpsiXML”)
R脚本 | RpsiXML方案的应用实例 | |
R脚本 | 阅读PSI-25 XML文件 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,蛋白质组学,软件 |
版本 | 2.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.3 (r - 2.8)(11年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | 方法,注释(> = 1.21.0),图(> = 1.21.0),Biobase,RBGL(> = 1.17.0),XML(> =测试盒框),超图(> = 1.15.2),AnnotationDbi |
进口 | |
链接 | |
建议 | org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,hom.Hs.inp.db,hom.Mm.inp.db,hom.Dm.inp.db,hom.Rn.inp.db,hom.Sc.inp.db,Rgraphviz,ppiStats,ScISI |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com |
取决于我 | ScISI |
进口我 | ScISI |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | RpsiXML_2.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | RpsiXML_2.26.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | RpsiXML_2.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RpsiXML |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RpsiXML |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RpsiXML/ |
包下载报告 | 下载数据 |