林格

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅林格。

R调查ChIP-chip Oligoarrays

Bioconductor版本:3.9

包林格推动ChIP-chip的主要分析数据。包装的主要功能是数据写入、质量评估、数据可视化和识别基因组区域显示ChIP-chip浓缩。包从罗氏函数处理双色寡核苷酸微阵列用于ChIP-chip项目,但也包含了更一般的函数ChIP-chip数据分析,考虑到数据提供RGList(生)或ExpressionSet(前处理)。的包使用函数从各种其他包Bioconductor项目和提供了额外的ChIP-chip-specific和NimbleGen-specific功能。

作者:Joern Toedling,奥列格•Sklyar Tammo克鲁格,沃尔夫冈·胡贝尔马特•里奇

维护人员:j . Toedling < jtoedling在yahoo.de >

从内部引用(R,回车引用(“林格”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“林格”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“林格”)

PDF	R脚本	罗氏Oligoarrays R调查
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.48.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(12.5年)
许可证