RNAinteract

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAinteract

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAinteract。

估计成对从多维交互功能

Bioconductor版本:3.9

RNAinteract估计基因相互作用等多维家里从图像中提取特征。屏幕被认为是进行多井盘子或类似的设计。从一个列表的功能(如细胞数量、面积、荧光强度)每好,估计遗传交互。包提供了交互功能报告基因对,策划的热图和双RNAi情节。可以编写一个HTML报告质量控制和分析。

作者:贝恩德•菲舍尔< b。费舍尔在dkfz.de >

维护人员:贝恩德•菲舍尔< b。费舍尔在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAinteract”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RNAinteract”)

PDF	R脚本	RNAinteract
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays,ImmunoOncology,预处理,质量控制,软件,可视化
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.12.0),abind,locfit,Biobase
进口	RColorBrewer,ICS,ICSNP,cellHTS2,geneplotter,gplots、网格hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、splots(> = 1.13.12)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	RNAinteractMAPK
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RNAinteract_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	RNAinteract_1.32.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	RNAinteract_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAinteract
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAinteract
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/
包下载报告	下载数据