准
doi：10.18129/b9.bioc.quasr
该包适用于生物导体的3.9版；对于稳定的最新版本，请参阅准。
量化和注释r中的简短读数
生物导体版本：3.9
该软件包为简短读取的量化和分析提供了一个框架。它涵盖了一个完整的工作流程，从原始序列读取，对比对的创建和质量控制图，再到目标基因组区域的量化。
作者：Anita Lerch，Charlotte Soneson，Dimos Gaiditzis和Michael Stadler
维护者：迈克尔·斯塔德勒（Michael Stadler）<迈克尔·斯塔德勒
引用（从r内，输入引用（“ Quasr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ quasr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ quasr”）
| html | R脚本 | Quasr简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，chipseq，，，，覆盖范围，，，，遗传学，，，，免疫学，，，，甲基，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.24.2 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（6。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 3.6），并行，基因组机（> = 1.13.3），rbowtie |
| 进口 | 方法，grdevices，图形，utils，生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges，，，，生物管理器，，，，生物酶，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，rsamtools（> = 1.99.1），GenomicFeatures（> = 1.17.13），Shortread（> = 1.19.1），基因组签名，，，，生物比较，，，，GenomeInfodB，，，，rtracklayer，，，，Genomicfiles，，，，RHISAT2，，，，AnnotationDbi |
| 链接 | Rhtslib（> = 1.15.3） |
| 建议 | GVIZ，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，COVR，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | quasr_1.24.2.tar.gz |
| Windows二进制 | quasr_1.24.2.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | quasr_1.24.2.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quasr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/quasr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/quasr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
