DOI:10.18129 / B9.bioc.PING

这个包是3.9版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见

基于mase或超声短读数据的核小体定位的概率推断

Bioconductor版本:3.9

基于经验贝叶斯混合模型方法的ChIP-Seq概率推断。

作者:张学魁<学张at jhsph.edu>, Raphael Gottardo , sunsoon Woo

维护者:Renan Sauteraud

引用(来自R,输入引用(“平”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PING")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“平”)

PDF R脚本 PING用户指南
PDF R脚本 使用PING对端测序数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类测序软件StatisticalMethod可视化
版本 2.28.0
在Bioconductor中 BioC 2.10 (R-2.15)(7.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.15.0),chipseqIRangesGenomicRanges
进口 方法,图片,图形,grDevices,统计,Gviz食品及药物管理局BSgenomestats4,BiocGenericsIRangesS4Vectors
链接
建议 平行,ShortReadrtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 PING_2.28.0.tar.gz
Windows二进制 PING_2.28.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) PING_2.28.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/PING
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/PING
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PING/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站-有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表-用于包开发人员bob电竞体育官网