PCATOOLS

doi:10.18129/b9.bioc.pcatools

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅PCATOOLS

PCATOOLS:所有主要组件分析

生物导体版本:3.9

主要成分分析(PCA)是一种非常强大的技术,在数据科学,生物信息学和更远的地方具有广泛的适用性。它最初是为了分析大量数据而开发的,以阐明被分析的逻辑实体之间的差异/关系。它提取数据的基本结构,而无需构建任何模型来表示。数据的“摘要”是通过减少的过程得出的,该过程可以将大量变量转换为不相关的较小数字,即主要组件,而同时可以轻松地对原始解释进行轻松解释。数据。

作者:凯文·布莱(Kevin Blighe),迈尔斯·刘易斯(Myles Lewis)

维护者:kevin blighe ,myles lewis

引用(从r内,输入引用(“ PCATOOLS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pcatools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PCATOOLS”)

html R脚本 PCATOOLS:所有主要组件分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(<6个月)
执照 GPL-3
要看 统计,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,RESHAPE2,,,,格子,grdevices,牛仔图
进口
链接
建议 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,生物酶,,,,地球,,,,Biomart,,,,ggplotify
系统要求
增强
URL https://github.com/kevinblighe/pcatools
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pcatools_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 pcatools_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) pcatools_1.0.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcatools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcatools
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pcatools/
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