该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅PCATOOLS。
生物导体版本:3.9
主要成分分析(PCA)是一种非常强大的技术,在数据科学,生物信息学和更远的地方具有广泛的适用性。它最初是为了分析大量数据而开发的,以阐明被分析的逻辑实体之间的差异/关系。它提取数据的基本结构,而无需构建任何模型来表示。数据的“摘要”是通过减少的过程得出的,该过程可以将大量变量转换为不相关的较小数字,即主要组件,而同时可以轻松地对原始解释进行轻松解释。数据。
作者:凯文·布莱(Kevin Blighe),迈尔斯·刘易斯(Myles Lewis)
维护者:kevin blighe
引用(从r内,输入引用(“ PCATOOLS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pcatools”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ PCATOOLS”)
html | R脚本 | PCATOOLS:所有主要组件分析 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,rnaseq,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.0.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(<6个月) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 统计,GGPLOT2,,,,Ggrepel,,,,RESHAPE2,,,,格子,grdevices,牛仔图 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 运行,,,,生物基因,,,,尼特,,,,生物酶,,,,地球,,,,Biomart,,,,ggplotify |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/kevinblighe/pcatools |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | pcatools_1.0.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | pcatools_1.0.0.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | pcatools_1.0.0.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pcatools |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pcatools |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pcatools/ |
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