PAA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAA

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PAA。

PAA(蛋白质阵列分析仪)

Bioconductor版本:3.9

PAA进口单一颜色(蛋白质)微阵列数据保存在探地雷达的文件格式,esp。ProtoArray数据。预处理(背景校正后,批过滤、正常化)单变量特性预选执行(例如,使用“最小M统计”方法,以下简称“彩信”)。随后,一个多元发现生物标志物进行特征选择的候选人。因此,消除frequency-based向后的方式或合奏可以使用特征选择。PAA提供了一个完整的工具箱的分析工具,包括几种不同的情节为结果检查和评估。

作者:迈克尔Turewicz (aut (cre),马丁eisenach(施,cre)

维护人员:迈克尔Turewicz <迈克尔。马丁eisenach turewicz rub.de >, <马丁。在rub.de eisenach >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(PAA)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (PAA)

PDF	R脚本	PAA教程
PDF		PAA_1.7.1.pdf
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类,微阵列,OneChannel,蛋白质组学,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(5年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可
取决于	R (> = 3.2.0),Rcpp(> = 0.11.6)
进口	e1071,gplots,gtools,limma,质量,mRMRe,randomForest,ROCR,股东价值分析
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,RUnit,BiocGenerics,vsn
SystemRequirements	c++软件随机丛林
增强了
URL	http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/PAA/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PAA_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	PAA_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	PAA_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PAA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PAA/
包下载报告	下载数据