有机体

doi:10.18129/b9.bioc.ornanism.dplyr

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅有机体

基于DPLYR的访问生物导体注释资源

生物导体版本:3.9

该软件包提供了生物通用器“注释”资源的替代接口,尤其是“ org”软件包(例如org.hs.eg.db)的基因标识符映射功能和“ TXDB”软件包的基因组坐标功能(例如,,TXDB.HSAPIENS.UCSC.HG38.NOWNE)。

作者:Martin Morgan [AUT,CRE],Yubo Cheng [CTB]

维护者:Martin Morgan

引用(从r内,输入引用(“有机体.dplyr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ asymism.dplyr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“有机体.dplyr”)

html R脚本 有机体
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 注解,,,,基因数,,,,测序,,,,软件
版本 1.12.1
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(2。5年)
执照 艺术2.0
依靠 r(> = 3.4),dplyr(> = 0.7.0),AnnotationFilter(> = 1.1.3)
进口 rsqlite,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,AnnotationDbi,方法,工具,utils,Biocfilecache,,,,DBI,,,,dbplyr
链接
建议 org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,org.mm.eg.db,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm10.ensgene,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,GGPLOT2
系统要求
增强
URL
取决于我 注解
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 有机体dplyr_1.12.1.tar.gz
Windows二进制 有机体dplyr_1.12.1.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) 有机体dplyr_1.12.1.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/organism.dplyr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/有机体。
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/organism.dplyr/
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