NCIgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.NCIgraph

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见NCIgraph

来自NCI路径数据库的路径

Bioconductor版本:3.9

提供各种方法来在R图对象中从NCI路径数据库加载路径并重新格式化它们。

作者:劳伦特·雅各布

维护者:Laurent Jacob < Laurent。雅各布在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“NCIgraph”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NCIgraph")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“NCIgraph”)

PDF R脚本 NCIgraph:来自NCI路径集成数据库的网络作为graphNEL对象。
PDF 参考手册

细节

biocViews GraphAndNetwork通路软件
版本 1.32.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(8.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10.0)
进口 KEGGgraph、方法、RBGLRCy3R.methodsS3
链接
建议 Rgraphviz
SystemRequirements
增强了 DEGraph
URL
全靠我
进口我 DEGraph
建议我 DEGraph
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 NCIgraph_1.32.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11 (El Capitan)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NCIgraph
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NCIgraph
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/NCIgraph/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网