这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见NCIgraph.
Bioconductor版本:3.9
提供各种方法来在R图对象中从NCI路径数据库加载路径并重新格式化它们。
作者:劳伦特·雅各布
维护者:Laurent Jacob < Laurent。雅各布在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“NCIgraph”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NCIgraph")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“NCIgraph”)
R脚本 | NCIgraph:来自NCI路径集成数据库的网络作为graphNEL对象。 | |
参考手册 |
biocViews | GraphAndNetwork,通路,软件 |
版本 | 1.32.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(8.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 2.10.0) |
进口 | 图,KEGGgraph、方法、RBGL,RCy3,R.methodsS3 |
链接 | |
建议 | Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | DEGraph |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | DEGraph |
建议我 | DEGraph |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | NCIgraph_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NCIgraph |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NCIgraph |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NCIgraph/ |
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