NBSplice

DOI:10.18129 / B9.bioc.NBSplice

这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见NBSplice．

负二项式模型检测差分拼接

Bioconductor版本:3.9

该方案提出了一种基于异构体定量的差分拼接评价方法。它应用负二项分布的广义线性模型来推断异构体相对表达的变化。

作者:加布里埃拉·a·梅里诺和埃尔默·a·费尔南德斯

维护者:Gabriela Merino <美利奴。Gabriela33在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NBSplice")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“NBSplice”)

超文本标记语言	R脚本	NBSplice-vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，ImmunoOncology，RNASeq，回归，软件，StatisticalMethod
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 3.5)，方法
进口	刨边机统计数据,质量，车，mppa，BiocParallel，ggplot2，reshape2
链接
建议	knitr，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.ar
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	NBSplice_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	NBSplice_1.2.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	NBSplice_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBSplice
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NBSplice
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NBSplice/
软件包下载报告	下载数据