该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅最小值。
生物导体版本:3.9
从高维基因分型平台中对三个从头拷贝数变体进行分析。
作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski
维护者:jhu.edu>的Robert B Scharpf
引用(从r内,输入引用(“最小值”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ minimumdistance”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“最小值”)
R脚本 | 在案例传统三重奏中检测从头拷贝数更改 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 库务,,,,微阵列,,,,SNP,,,,软件 |
版本 | 1.28.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.10(R-2.15)(7。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.3),香草(> = 1.31.3) |
进口 | 方法,生物基因,,,,生物酶,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.17.16),总结性特征(> = 0.2.0),寡群,,,,DNACOPIGY,,,,ff,,,,foreach,,,,矩阵,,,,格子,,,,Data.Table,网格,统计,utils |
链接 | |
建议 | Human610Quadv1bcrlmm(> = 1.0.3),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Snpchip,,,,运行 |
系统要求 | |
增强 | 雪,,,,Dosnow |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | minimumdistance_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | 最小值_1.28.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | MINUMIMDISTANCE_1.28.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/minimumdistance |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/最小值 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/minimumdistance/ |
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