最小值

doi:10.18129/b9.bioc.minimumdistance

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅最小值

案例传统三重奏中的从头CNV检测的包装

生物导体版本:3.9

从高维基因分型平台中对三个从头拷贝数变体进行分析。

作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护者:jhu.edu>的Robert B Scharpf

引用(从r内,输入引用(“最小值”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ minimumdistance”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“最小值”)

PDF R脚本 在案例传统三重奏中检测从头拷贝数更改
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,微阵列,,,,SNP,,,,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(7。5年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.3),香草(> = 1.31.3)
进口 方法,生物基因,,,,生物酶,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.17.16),总结性特征(> = 0.2.0),寡群,,,,DNACOPIGY,,,,ff,,,,foreach,,,,矩阵,,,,格子,,,,Data.Table,网格,统计,utils
链接
建议 Human610Quadv1bcrlmm(> = 1.0.3),bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Snpchip,,,,运行
系统要求
增强 ,,,,Dosnow
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 minimumdistance_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 最小值_1.28.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) MINUMIMDISTANCE_1.28.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/minimumdistance
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/最小值
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/minimumdistance/
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