甲基赛克

doi:10.18129/b9.bioc.methylseekr

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅甲基赛克

BIS-SEQ数据的分割

生物导体版本:3.9

这是从BIS-SEQ数据发现监管区域的软件包

作者:Lukas Burger,Dimos Gaidatzis,Dirk Schubeler和Michael Stadler

维护者:lukas Burger

引用(从r内,输入引用(“甲基甲基”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“甲基塞克”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“甲基赛克”)

PDF R脚本 甲基赛克
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,甲基,,,,测序,,,,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(6。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 rtracklayer(> = 1.16.3),并行(> = 2.15.1),MHSMM(> = 0.4.4)
进口 iranges(> = 1.16.3),BSGENOME(> = 1.26.1),基因组机(> = 1.10.5),Geneplotter(> = 1.34.0),图形(> = 2.15.2),grdevices(> = 2.15.2),并行(> = 2.15.2),stats(> = 2.15.2),utils(> = 2.15。2)
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 甲基管
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 甲基Seekr_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 甲基Seekr_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) 甲基Seekr_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylseekr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ethylseekr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/methylseekr/
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