MethTargetedNGS

DOI:10.18129 / B9.bioc.MethTargetedNGS

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MethTargetedNGS。

对新一代测序数据进行甲基化分析

Bioconductor版本:3.9

一步一步执行的甲基化分析下一代测序数据。

作者:穆罕默德阿贾米尔Holger Frohlich教授和Priv.-Doz的贡献。奥斯曼El-Maarri博士

维护人员:穆罕默德阿贾米尔<同上。在gmail.com ahmerjamil >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MethTargetedNGS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MethTargetedNGS”)

PDF	R脚本	介绍MethTargetedNGS
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,DataImport,遗传学,ResearchField,SequenceMatching,测序,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.1.2),stringr,seqinr,gplots,Biostrings
进口
链接
建议
SystemRequirements	HMMER3
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MethTargetedNGS_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	MethTargetedNGS_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MethTargetedNGS_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MethTargetedNGS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MethTargetedNGS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MethTargetedNGS/
包下载报告	下载数据