米拉
DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA
这个包适用于Bioconductor 3.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见米拉．
甲基化调控活性的推断
Bioconductor版本:3.9
MIRA测量感兴趣的调控位点(如转录因子结合位点)周围甲基化水平的“下降”程度，用于整个基因组中该类型位点的实例，然后用于推断调控活性。
作者:Nathan Sheffield
维护者:John Lawson
引文(从R内，输入引用(“米拉”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MIRA")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“米拉”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MIRA在生物学问题中的应用 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 以甲基化为基础的调控活性推断 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq，报道，DNAMethylation，表观遗传学，FunctionalGenomics，GeneRegulation，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，MethylSeq，测序，软件，SystemsBiology |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 3.5) |
| 进口 | BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，data.table，ggplot2，Biobase统计数据,bsseq、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr平行,testthat，BiocStyle，rmarkdown，AnnotationHub，萝拉 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://databio.org/mira |
| BugReports | https://github.com/databio/MIRA |
| 全靠我 | |
| 进口我 | 可可 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | MIRA_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MIRA_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MIRA_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MIRA |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MIRA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
