林肯

DOI:10.18129 / B9.bioc.LINC

这个包是3.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅林肯。

co-expression lincRNAs和蛋白质编码基因

Bioconductor版本:3.9

这个包提供了一些方法来计算co-expression lincRNAs网络和蛋白质编码基因。生物方面相关的组蛋白编码基因预测的生物环境lincRNAs根据“有罪”的方法。

作者:Manuel Goepferich卡尔·赫尔曼

维修工:Manuel Goepferich <曼努埃尔。在gmx.de goepferich >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“林肯”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(林肯)

HTML	R脚本	林肯——Co-Expression lincRNAs分析
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文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion,GeneExpression,GeneRegulation,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.3.1)、方法、统计数据
进口	Rcpp(> = 0.11.0)它,剂量,ggtree,gridExtra,猿、网格png,Biobase,股东价值分析,reshape2,grDevices跑龙套org.Hs.eg.db,clusterProfiler,ggplot2,ReactomePA
链接	Rcpp
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr,biomaRt
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	LINC_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	LINC_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	LINC_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LINC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/林肯
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/LINC/
包下载报告	下载数据